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< "https:">提供的《学霸的模拟器系统》 第136章 问道与论道（求订阅求月票）(第1/2页)
芝加哥大学。
低温电镜中心,晚上十点半。
程新竹烦躁地抓了抓头发,将一张废掉的铜网丢进垃圾桶。
她已经在这里耗了整整一周。
格林伯格教授的评价像一根刺,扎在她心里。
为了解决“构象异质性”的问题,她回归了最传统、最笨的办法??优化样品制备。
她尝试了不同的缓冲液配方,调整了冷冻时的降温速率,甚至换用了更昂贵的,表面经过特殊处理的碳支持膜。
结果毫无改善。
她得到的,依旧是一群面目模糊的“幽灵”。
程新竹靠在冰冷的实验台上,感觉一阵无力。
她知道自己钻进了牛角尖,却找不到出口。
】:你之前说,你们的cryo-e数据,是“连续曝光”的?
程新竹嘟了嘟嘴,觉得有点烦躁。
这人,问这废话干嘛啦?
但她还是礼貌地回了消息。
【竹子不是猪】:当然是连续曝光啊,不然怎么追踪动态过程?哎呀,我们都是把几万张图叠加取平均,来提高信噪比的。你问这个干嘛?
接下来,是良久的沉默。
十分钟后,那边才发来一条消息。
【l】:我想,我们都错了。
看着莫名其妙的留言,程新竹索性拿起手机,拨通了林允宁的号码。
“喂?看到我的消息了么?”
电话那头,林允宁的声音很清醒,不像刚睡醒的样子。
“我失败了。”
程新竹自顾自地抢先抱怨,声音有些沮丧,“样品优化没用,构象异质性是这个体系固有的性质,绕不开。”
“我知道。”
“你知道?”
程新竹愣了一下,“那你这几天在干嘛?找到解决办法了?”
电话那头沉默了几秒,然后传来林允宁平静的声音。
“你现在有空吗?开车来一趟i-hoe,我们当面聊。”
一刻钟后,国际学生公寓一楼大厅。
这里像个小型联合国,几个印度学生围着一张桌子打牌,角落里两个韩国女生在用笔记本看韩剧。
空气中飘着一股咖啡和黄油面包的混合味道。
林允宁正站在一张破旧的台球桌旁,手里拿着一根磨损严重的球杆,面前摆着一个标准的开球三角。
程新竹风风火火地冲了进来,看到这场景有点懵。
“你叫我来,该不是陪你打台球吧?”
“你看。”
林允宁没回答,他俯下身,一杆大力开球。
“砰”的一声闷响,白球撞入球堆,彩球四散开来,滚向桌面各处,最终停在不同的位置。
“这就是我们之前在做的事,”
林允宁直起身,用球杆指了指桌面上混乱的彩球,“我们想通过观察这些球最终停在哪,来反推出开球时,白球的速度和角度。这是‘观相’。”
他走到桌边,把所有彩球重新摆回三角形。
“但我们忽略了一点,”
他再次俯身,这一次,他用了一个完全不同的角度和力道,轻轻一推。
白球慢悠悠地滚过去,踏开球堆,彩球们互相碰撞,走出了完全不同的轨迹,最终停在了另一组位置上。
“同样的开球状态,只要中间的‘路径’稍微有点不同,终点就天差地别。”
林允宁放下球杆,看着程新竹。
“构象异质性’不是需要被消除的噪声,它本身就是蛋白质错误折叠‘路径”的痕迹!我们一直想看清终点,却忘了去记录过程。”
程新竹的眼睛亮了。她快步走到台球桌旁,拿起一颗红球。
“我懂了......所以,我们不应该把几万张图叠加平均,那会抹掉所有的路径信息。我们应该把它们......串起来?”
“对。”
“但这怎么做?"
程新竹的眉头又皱了起来,“每一张图都是一个独立的快照,我们怎么知道哪一张在前,哪一张在后?它们之间没有时间顺序啊!”
“所以我们要放弃‘重建”的思路,”
林允宁领着她,
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