林伯格的眼睛,用了一个更精确的比喻。
“这本质上是一个信息重构问题。我们手里有几万张分辨率极高的‘藏宝图碎片,也就是处理过后的冷冻电镜图像。
“我的算法,就是一套寻找‘最经济的拼接方式’的规则。
“它会不断尝试各种拼接的可能性,每拼接一块,就计算一次当前这幅画的‘信息熵'',或者说‘混乱程度”。然后,它会永远选择让整幅画变得更清晰,更符合物理规律的那一种拼接方案。”
格林伯格静静地听着,脸上的表情从审视,慢慢变成了凝重。
他追问了一个核心问题:
“你怎么定义''更符合物理规律?这是关键。否则,你的算法只会给你一条数学上最漂亮,但生物学上毫无意义的曲线。
“我们用了两个强约束,”
林允宁回答,“第一,路径在能量上必须是连续下降的,不能凭空翻越无法逾越的能垒。
“第二,路径上的每一个中间态,它的二维投影,必须能在您那几万张实验图像中,找到统计意义上高度相似的匹配。
“我们用实验数据,给这个数学模型,制定了一个‘罗盘''。”
话音落下。
办公室里陷入了长久的沉默。
格林伯格没有说话,他只是摘下眼镜,用指节用力按压着眉心。
他站起身,在巨大的落地窗前踱步,然后猛地转过身,眼神里是
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</div>< "https:">提供的《学霸的模拟器系统》 第142章 这不是高中兴趣小组（求订阅求月票）(第2/2页)
一种林允宁从未见过的、混杂着震惊与兴奋的光芒。
“把你的电脑连上投影。”
他用不容置疑的语气说道。
林允宁将笔记本接上投影仪,屏幕上出现了那条穿越了上千个数据点的红色轨迹。
“很好”
格林伯格走到屏幕前,指着轨迹中间那个突兀的“尖峰”,“把这个过渡态结构,单独渲染出来。”
林允宁敲了几个命令,那个结构极其扭曲的蛋白质三维模型,出现在幕布上。
格林伯格死死地盯着那个模型,像是要把它的每一个原子都看穿。
他快步走回办公桌,打开电脑,在googleschor里飞快地输入了几个关键词。
很快,一篇刚刚在线发表在《细胞》上的论文被他调了出来。
他将其中一张插图放大,拖到屏幕的左侧。
那是一张用核磁共振技术解析出的、某个蛋白质片段的结构图。
然后,他将林允宁渲染出的那个过渡态模型,拖到了屏幕右侧。
“看这里。”
他用鼠标指针,在两张图上一个相同的位置,画了一个红圈。
左边,是斯坦福大学医学院一个顶级实验室,耗费数百万美元的设备和两年时间,刚刚找到的一个潜在的阿尔茨海默症药物靶点。
右边,是林允宁和程新竹用一台普通的戴尔工作站,花了一周时间,“反推”出来的中间体结构。
两个来自不同实验室,用完全不同的方法得到的三维模型,在屏幕上并排显示。
除了因为分辨率不同而导致的细节差异,整体的骨架结构、关键氨基酸残基的相对位置......
几乎一模一样。
"......"
程新竹捂住了嘴,眼睛瞬间红了。
这不是巧合。
这是来自真实物理世界的、最无可辩驳的证据。
“他们花了两年的时间,用了世界上最顶级的核磁共振设备,找到了这一个潜在的药物靶点。
格林伯格转过身,看着林允宁和程新竹,眼神里是前所未有的激动。
“而你们,用了一周的时间,不仅独立地验证了他们的发现……………”
他伸出手指,在屏幕上那条红色的轨迹上,另外三个稍小的能量尖峰处,依次点了点。
“......而且,很可能还找到了另外三个,全世界都还不知道的,全新的潜在靶点。”
他看着眼前的两个年轻人,一字一顿地说道:
“你们知道,这意味着什么吗?”
他回到办公桌前,拿起电话,直接拨通了计算中心主任的号码。
“是我,大卫?格林伯格。请为我预留beowulf集群的计算资源,最高优先级,全部供给我的学生程新竹。对,全部。''
他挂掉电话,又看向林允宁和程新竹。
这一次,他的眼神里不再有审视,只有纯粹的,一个科学家对开创性工作的欣赏。
“你们立刻回去,用全部数据,把完整的路径网络跑出来。林,我想你可能需要额外写一个关于这套算法的具体细节。”
他顿了顿,语气变得无比郑重。
“你提出的这个算法,价值无可估量。在论文发表之前,我们必须立刻联系学校的技术转让办公室,为它的核心部分,申请专利。”
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